Первый заместитель Премьер-министра Правительства Республики Башкортостан - министр сельского хозяйства Республики Башкортостан Ш.Х.Вахитов

• Правительственная комиссия по регулированию производства и оборота этилового спирта из пищевого сырья, алкогольной и спиртосодержащей продукции;
• Межведомственная республиканская комиссия по финансовому оздоровлению сельскохозяйственных товаропроизводителей;
• Координационный совет по определению приоритетных направлений развития аграрной науки и инновационной деятельности в агропромышленном комплексе Республики Башкортостан;
• Конкурсная комиссия по рассмотрению заявок на получение в пользование территорий, акваторий Республики Башкортостан, необходимых для осуществления пользования объектами животного мира, отнесенными к объектам охоты.

Первый заместитель Премьер-министра Правительства Республики Башкортостан - министр финансов Республики Башкортостан А.Р.Гаскаров

• Комиссия по вопросам формирования налоговой базы и бюджета местного самоуправления Совета по местному самоуправлению при Президенте Республики Башкортостан;
• Межведомственный координационный совет по реализации программы реформирования государственных финансов Республики Башкортостан;
• Координационный совет по вопросам страхования при Правительстве Республики Башкортостан;
• Правительственная комиссия Республики Башкортостан по вопросам эффективного и целевого использования средств бюджета Республики Башкортостан;
• Правительственная комиссия Республики Башкортостан по информатизации;
• Межведомственная правительственная комиссия по обеспечению своевременного и качественного формирования проекта бюджета Республики Башкортостан;
• Межведомственная комиссия по совершенствованию налогового законодательства в Республике Башкортостан;
• Методологический совет по бюджетному учету.

Заместитель Премьер-министра Правительства Республики Башкортостан - министр промышленности, инвестиционной и инновационной политики Республики Башкортостан Ю.Л.Пустовгаров

• Совет внебюджетного инновационного фонда Республики Башкортостан;
• Экспертный совет;
• Республиканская комиссия по подведению итогов соревнования предприятий (организаций) основных отраслей экономики Республики Башкортостан;
• Контрольно-координационная комиссия по проведению торгов;
• Комиссия по проведению республиканского конкурса "Лучшие товары Башкортостана";
• Башкирское региональное отделение Комиссии по организации подготовки управленческих кадров для организаций народного хозяйства Республики Башкортостан;
• Комиссия по телевидению и радиовещанию;
• Республиканский художественно-экспертный совет по народным художественным промыслам;
• Правительственная комиссия по чрезвычайным ситуациям и обеспечению пожарной безопасности;
• Совет по защите информации от иностранных технических разведок и от ее утечки по техническим каналам;
• Республиканский совет по поддержке предпринимательства;
• Межведомственная комиссия по защите потребительского рынка;
• Межведомственный совет по проблемам экономического развития Республики Башкортостан в условиях вступления России во Всемирную торговую организацию.

Заместитель Премьер-министра Правительства Республики Башкортостан - министр культуры и национальной политики Республики Башкортостан И.Г.Илишев

• Комиссия по делам несовершеннолетних и защите их прав;
• Комиссия по проведению конкурса научных работ молодых ученых и молодежных научных коллективов на соискание грантов Республики Башкортостан;
• Комиссия по присуждению премий имени Сагита Худайбердина;
• Республиканский научно-методический совет по сохранению недвижимых объектов культурного наследия;
• Республиканская комиссия по определению стипендиатов Президента Республики Башкортостан из числа особо одаренных детей;
• Межведомственная экспертная комиссия по рассекречиванию документов, созданных Башкирской организацией КПСС;
• Редколлегия Книги памяти Республики Башкортостан
• Комиссия по реализации Закона Республики Башкортостан "О языках народов Республики Башкортостан".

Заместитель Премьер-министра Правительства Республики Башкортостан - министр труда и социальной защиты населения Республики Башкортостан Ф.А.Ямалтдинов

• Комиссия Правительства Республики Башкортостан по профилактике правонарушений и борьбе с преступностью;
• Республиканская комиссия по восстановлению прав реабилитированных жертв политических репрессий;
• Республиканская межведомственная комиссия по обеспечению отдыха, оздоровления и занятости детей, учащихся и студентов;
• Правительственная комиссия по противодействию злоупотреблению наркотическими средствами и их незаконному обороту;
• Резервный состав призывной комиссии Республики Башкортостан;
• Межведомственная комиссия по миграционной политике;
• Правительственная комиссия по контролю за ходом реализации Программы социальной поддержки населения и наблюдению за изменением уровня жизни населения;
• Комиссия по профилактике пьянства и алкоголизма;
• Координационный Совет по делам инвалидов при Правительстве Республики Башкортостан;
• Межведомственная комиссия по проблемам предупреждения распространения ВИЧ-инфекции в Республике Башкортостан;
• Межведомственная комиссия по охране труда;
• Межведомственная комиссия по реализации Программы развития санаторно-курортной системы Республики Башкортостан на 2002 - 2010 годы;
• Межведомственная комиссия по охране здоровья граждан;
• Санитарно-противоэпидемическая комиссия;
• Координационный комитет содействия занятости населения Республики Башкортостан;
• Межведомственный координационный совет по охране здоровья детей и подростков в образовательных учреждениях;
• Комиссия по вопросам бронирования граждан, пребывающих в запасе;
• Республиканская комиссия по эвакуации.